1、無載氣通過時(shí)，PE毛細(xì)柱的固定液熱分解較迅速。所以安裝調(diào)試人員和培訓(xùn)工程師定會對操作人員強(qiáng)調(diào)：在柱箱(爐)升溫前一定要先通上載氣(這與TCD操作要求相似)，在柱箱冷卻后方能關(guān)載氣。

　　2、氣相色譜載氣中若夾帶灰塵或其它顆粒狀物體就可能導(dǎo)致色譜柱迅速損壞，同時(shí)還應(yīng)注意不能讓微粒或灰塵進(jìn)入汽化室，因此在載氣進(jìn)入儀器管路前必需凈化器。

　　3、載氣中的水分通過固定液的液膜吸附在體內(nèi)表面上，將會取代或破壞固定液液膜，所以，固定液極性越強(qiáng)，越需要采用干燥的載氣，例如：像OV-1、SE-30、SE-54、OV-101對載氣干燥要求不高，而PEG20M、FFAP和SP1000對載氣要求就很高。

　　但在涂布于碳酸鋇沉積層上的柱子情況就恰恰相反，涂極性固定液的PE毛細(xì)柱能經(jīng)受含水樣品的直接進(jìn)樣，而涂非極性固定液的柱反而不能經(jīng)受含水樣品。但不管如何，載氣進(jìn)入管路前最好都應(yīng)進(jìn)行脫水處理。

　　4、對于那些能被氧化的固定液(如PEG-20M、Carbowax、FFAP等)，對載氣除氧也很重要，由于N2和He中含O2較高，而H2中含 O2少，所以，ECD、FID常用高純N2作載氣，TCD用H2作載氣。同時(shí)，停機(jī)使用時(shí)，應(yīng)將排空端密封住，以防止空氣中的氧氣對色譜柱固定液的氧化作用。

　　5、在大多數(shù)情況下，柱的壽命與它的使用溫度成反比。采用稍低些的溫度上限，可顯著提高柱的壽命，程序升溫到較高溫度所維持的時(shí)間越短對柱的壽命影響越小。(見本頁附表)

　　6、水、醇(尤其是甲醇)、二硫化碳這類的溶劑，有著非常強(qiáng)的置換固定液的能力，因此用于有意將相當(dāng)大量的溶劑聚集在柱上(溶劑效應(yīng))的氣相色譜不分流進(jìn)樣法以及柱上進(jìn)樣法的溶劑，應(yīng)根據(jù)它們對柱壁的吸附親和力(或固定液被置換的可能性)小心的加以選擇。(例如：甲醇不宜用于PEG20M,丙酮往往會引起引起硅酮降解。)

　　7、PE毛細(xì)柱最大特點(diǎn)是高柱效，但是柱效不僅反映了柱本身的質(zhì)量，而且還包括進(jìn)樣過程的整個(gè)系統(tǒng)總效率，也就是說，自樣品進(jìn)入系統(tǒng)的一瞬間開始到出峰為止，每一個(gè)能影響峰寬或分離效果的因素，如進(jìn)樣器、柱的連接、輔助氣引入位置、管路死體積、進(jìn)樣器內(nèi)襯的毛病等等，都一定會影響柱效。

　　8、一根好的柱子，由于安裝不當(dāng)，可以造成理論塔板數(shù)降低，峰形增寬或拖尾、活性物質(zhì)的吸附性拖尾或消失、靈敏度降低或組分分離不佳等等。